IPA(IPA Pathway Analysis)是一個一體化的在線整合分析軟件(www.ingenuity.com),用于分析基因表達(dá)數(shù)據(jù)、microRNA數(shù)據(jù)和小規(guī)模實驗數(shù)據(jù)。它建立了可視化的實驗系統(tǒng),基于基因、蛋白質(zhì)、化學(xué)物質(zhì)、藥物等各種分子...
游離脂肪酸(FFA)即非酯化脂肪酸,主要來源于脂蛋白和脂肪組織內(nèi)甘油三酯(TG)的降解。脂肪細(xì)胞內(nèi)的TG 在各種脂肪酶作用下被水解為FFA和甘油,被機體各組織利用。有研究表明游離脂肪酸與心血管疾病、肝臟疾病、二...
短鏈脂肪酸(SCFAs),主要包括乙酸、丙酸、丁酸、異丁酸、戊酸、異戊酸,是由微生物對未被消化的碳水化合物(少數(shù)情況下是蛋白)發(fā)酵產(chǎn)生,SCFAs逐漸作為調(diào)節(jié)飲食、腸道微生物和宿主的信號分子而被人熟知,在腸道中...
氨基酸(Amino acids)及其衍生物是在分子中既含有氨基同時又含有羧基的一類化合物。在生物體內(nèi)以游離或結(jié)合狀態(tài)出現(xiàn)。游離氨基酸分布于一切動物細(xì)胞及體液內(nèi),而結(jié)合氨基酸主要是蛋白質(zhì)及肽類的基本組成成分。產(chǎn)品...
定量靶標(biāo)檢測是以標(biāo)準(zhǔn)品為參考,針對特定某一物質(zhì)或一類代謝物進(jìn)行檢測的代謝組學(xué)方法,選擇特異性的樣本前處理方法,優(yōu)化色譜分離及質(zhì)譜條件等對這些代謝物進(jìn)行最優(yōu)化檢測,大大提高了檢測的靈敏度、準(zhǔn)確性、特異性...
基于LC-MS的代謝組數(shù)據(jù)的固有特性要求我們使用多元變量統(tǒng)計分析方法對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。相比于傳統(tǒng)的單變量統(tǒng)計分析方法(univariate analysis, UVA)如Student t檢驗、方差分析(analysis of variance, ANOVA)等更加...
對樣本進(jìn)行主成分分析能從總體上反應(yīng)各組樣本之間的總體代謝差異和組內(nèi)樣本之間的變異度大小。使用SIMCA軟件(V14.1, Umetrics, Umea, Sweden)對數(shù)據(jù)進(jìn)行UV格式化(Unit Variance Scaling)和平均中心化(Mean-Center...
通過氣質(zhì)聯(lián)用(GC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化,重點尋找在實驗組和對照組中有顯著變化的代謝物,進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系,其研究對象大都是分子量1500D...
通過液質(zhì)聯(lián)用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動態(tài)變化,重點尋找在實驗組和對照組中有顯著變化的代謝物,進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系,其研究對象大都是分子量1500D...