代謝物鑒定教程：必收藏！詳細(xì)版METLIN網(wǎng)站使用指南

邁維代謝

2022.11.10

Metlin數(shù)據(jù)庫全稱Metabolite Link（https://metlin.scripps.edu），由The Scripps Institute Gary Siuzdak于2003年創(chuàng)建，2005年對公眾開放，最初是一個用于描述已知代謝物的特征的數(shù)據(jù)庫，主要側(cè)重用于液質(zhì)非靶向代謝組學(xué)（Non-targetedMetabolomics）代謝物鑒定領(lǐng)域，此后擴展為識別已知和未知代謝物和其他化學(xué)實體的技術(shù)平臺。

目前Metlin數(shù)據(jù)庫包括超百萬種小分子物質(zhì)，括脂質(zhì)，氨基酸，碳水化合物，毒素，小肽和天然產(chǎn)品等類別，超431000個高分辨率MS/MS質(zhì)譜圖。該庫的主要特征是含有大量代謝物的二級質(zhì)譜圖，而且每個化合物都有多種不同碰撞能的圖譜，可以清晰的找到代謝物的碎片離子，用戶還可以獲得分子量、化學(xué)式、化學(xué)結(jié)構(gòu)等信息。

據(jù)報道，METLIN數(shù)據(jù)庫中的質(zhì)譜圖可與多個廠商的質(zhì)譜儀產(chǎn)生的譜圖進行良好匹配，其中包括AB公司的Triple TOF 5600，安捷倫的6460 Triple Quad，Thermo的Q-Exactive和LTQ Orbitrap Velos（使用任何一種CID或HCD碰撞形式）等。

METLIN是一個強大的代謝物鑒定及代謝物信息查詢的數(shù)據(jù)庫。主頁中有”Simple Search“和”Advanced Search”兩種檢索方式，網(wǎng)站主頁如下圖。

“Simple Search”模塊中研究者進行單個質(zhì)荷比搜索，可以輸入物質(zhì)的分子量、質(zhì)量偏差、正/負(fù)離子模式、加和離子等信息進行搜索，還可通過設(shè)置過濾掉多肽、毒物等物質(zhì)，或者直接設(shè)置所包含的元素信息，便于更精準(zhǔn)的定性到目標(biāo)物。如果我們有質(zhì)譜數(shù)據(jù)，需要進行物質(zhì)定性，那么可以使用這個模塊。但是通常都會匹配出來多個物質(zhì)，那么進一步就需要自己的專業(yè)知識去進行篩選和判斷了。

“Advanced Search”為高級搜索，可根據(jù)物質(zhì)的METLIN編號、英文名稱、化學(xué)式、CAS號、KEGG號、分子量范圍等信息進行檢索，這些選項不需要全部都填，填一個或幾個都可以的。

例如，假設(shè)我們想知道trimethylamine oxide（氧化三甲胺）這個物質(zhì)在METLIN數(shù)據(jù)庫里有沒有，就可以在“Name”這里輸入英文名字。如果想要精確匹配，則可以勾選下面的“Name Exact Match”選項；如果對于想要查的物質(zhì)的英文名不是太確定，就無需勾選此選項，那么與這個名字相關(guān)的物質(zhì)都會被搜出來。最后，

但由于METLIN網(wǎng)站現(xiàn)在已經(jīng)商業(yè)化，因此以上介紹的檢索功能在國內(nèi)已無法免費使用，需要購買，而且價格比較昂貴。

敲重點

為了給科研工作者們提供更全面更準(zhǔn)確的代謝物數(shù)據(jù)信息，邁維代謝購買了METLIN網(wǎng)站的商業(yè)版數(shù)據(jù)庫用于LC-MS/MS非靶代謝組學(xué)的代謝物鑒定研究。所以各位老師可以直接把樣本提供給我們，我們負(fù)責(zé)交付給您精準(zhǔn)的鑒定結(jié)果以及全面的分析數(shù)據(jù)！

邁維代謝非靶優(yōu)勢

強大的檢出能力直接取決于非靶的數(shù)據(jù)庫以及物質(zhì)鑒定方法，邁維非靶數(shù)據(jù)庫現(xiàn)有物質(zhì)數(shù)超29萬+，采用4種鑒定方法，已實現(xiàn)代謝物的全面鑒定。

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超大數(shù)據(jù)庫

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超全定性方法

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