深度剖析 | NovoCyte Quanteon流式細(xì)胞儀對小鼠造血干細(xì)胞和祖細(xì)胞進(jìn)行14色表型分析
臨床上已成功將骨髓中分離出的造血干/祖細(xì)胞(HSPCs)用于造血干細(xì)胞移植多年,并可以利用一系列細(xì)胞表面標(biāo)記物對這些細(xì)胞進(jìn)行流式鑒定。因此,我們開發(fā)并優(yōu)化了一個(gè)14色的流式實(shí)驗(yàn)方案用于深入分析CD45.1和CD45.2的小鼠骨髓造血干細(xì)胞(HSCs),5個(gè)多能祖細(xì)胞類群(MPPs),淋系定向祖細(xì)胞類群(CLP)和8個(gè)髓系定向祖細(xì)胞類群。
在該方案中,每個(gè)細(xì)胞群都通過特異性表達(dá)的細(xì)胞表面標(biāo)記物來區(qū)分,并且使用DUMP通道將表達(dá)譜系標(biāo)記物(CD3,CD11b,B220,Gr-1,Ter119)的細(xì)胞排除。HSCs和MPPs可以通過分析細(xì)胞表面蛋白Sca-1,c-Kit,CD150,CD48,CD34和CD135來鑒定。它們被定義為:HSCs (LSK、CD150+、CD48-、CD34-、CD135-)、MPP1 (LSK、CD150+、CD48-、CD34+、CD135-)、MPP2(LSK、CD150+、CD48+、CD135-)、MPP3 (LSK、CD150-、CD48+、CD135-)、MPP4(LSK、CD150-、CD48+、CD135+)和 MPP5(LSK、CD150-、CD48-、CD135-)。
此外,髓系定向祖細(xì)胞(髓系祖細(xì)胞,CMP;粒細(xì)胞-巨噬細(xì)胞祖細(xì)胞,GMP;巨核細(xì)胞-紅細(xì)胞祖細(xì)胞,MEP;單能巨核細(xì)胞祖細(xì)胞,MkP;粒細(xì)胞-巨噬細(xì)胞祖細(xì)胞前體細(xì)胞,Pre GM;巨核細(xì)胞-紅細(xì)胞祖細(xì)胞前體細(xì)胞,Pre MegE;紅系細(xì)胞集落形成單位,CFU-E和Pre CFU-E)等由Sca-1和c-Kit加CD16/32,CD34,CD41,CD105和CD150的特異性表達(dá)鑒定:CMP(LK,CD34 +,CD16 / 32-), GMP (LK, CD34+, CD16/32+),MEP(LK, CD34-, CD16/32-), MkP(LK, CD150+, CD41+), Pre GM(LK, CD150-CD105-CD41-CD16/32-),Pre MegE(LK, CD150+CD105-CD41-CD16/32-), CFU-E(LK,CD150-CD105+CD41-CD16/32-)和Pre CFU-E (LK,CD150+CD105+CD41-CD16/32-)。然后在Sca-1和c-Kit低表達(dá)的細(xì)胞群中進(jìn)一步分析CD135和CD127以區(qū)分CLP(LSlowKlow,CD135 + CD127 +)。
14色HSPCs方案基于安捷倫 NovoCyte Quanteon 流式細(xì)胞儀所開發(fā),Quanteon配備 4 個(gè)激光器(405 nm、488 nm、561 nm 和 637 nm)和 25 個(gè)熒光檢測器。對小鼠造血干細(xì)胞的深層次表型進(jìn)行表征,大大提高我們對HSCs、MPPs以及成熟血細(xì)胞之間關(guān)系的理解。
手動(dòng)圈門策略
首先,F(xiàn)SC-H / A,SSC-H / A和width參數(shù)用于排除細(xì)胞碎片和粘連細(xì)胞,然后圈出活細(xì)胞與Lineage-(Lineage marker包括CD3,Gr-1,CD11b,CD45R,Ter-119)的成熟造血細(xì)胞,在活細(xì)胞和Lineage-中分析CD45.1和CD45.2表達(dá)(圖2A)。隨后,在CD45.1和CD45.2細(xì)胞群中分析HSPCs各類群(圖2B,2C)。LK(Lineage-、Sca-1-、c-Kit+)、LSK(Lineage-、Sca-1+、c-Kit+)和LSlowKlow(Lineage-、Sca-1low、c-Kitlow)是根據(jù)Sca-1 和 c-Kit的表達(dá)來定義的(i)。此外,在LK細(xì)胞類群中對髓系定向祖細(xì)胞進(jìn)一步分析:CMP(LK,CD34 +,CD16 /32-),GMP(LK,CD34 +,CD16 / 32 +),MEP(LK,CD34-,CD16 / 32-),MkP(LK,CD150 +,CD41 +),Pre GM(LK,CD150-CD105-CD41-CD16 /32-),Pre MeE(LK,CD150 + CD105-CD41-CD16 / 32-),CFU-E(LK,CD150-CD105 + CD41-CD16 / 32-)和Pre CFU-E(LK,CD150 + CD105 + CD105 + CD41 - CD16 / 32-)(ii)。在LSK細(xì)胞群中進(jìn)一步分析HSCs和MPP 1-5亞群:HSCs(LSK、CD150+、CD48-、CD34-、CD135-)、MPP1(LSK、CD150+、CD48+、CD135-)、MPP2(LSK、CD150+、CD48+)、MPP3(LSK、CD150-、CD48+、CD135-)、MPP4(LSK、CD150-、CD48+、CD135+)和MPP5(LSK、CD150-、CD48-)(iii)。最后,根據(jù)CD135和CD127的表達(dá)來區(qū)分CLP細(xì)胞(LSlowKlow,CD135+,CD127+)(iv)。
圖 1. 小鼠HSPCs各類群分析的手動(dòng)圈門邏輯。(A)首先去除細(xì)胞碎片、粘連細(xì)胞、死細(xì)胞和成熟造血細(xì)胞,然后分析CD45.1和CD45.2的表達(dá)。(B. C)在隨后的分析中,以CD45.1和CD45.2細(xì)胞群的Sca-1和c-Kit的表達(dá)來定義LK和LSK細(xì)胞群以及LSlowKlow細(xì)胞群:(i)然后在LK細(xì)胞中分析CMP,GMP,MEP,Pre GM, Pre MegE, Pre CFU-E, CFU-E and MkP各細(xì)胞群。(ii) 在LSK細(xì)胞群中進(jìn)一步鑒定HSC和MPP1-5細(xì)胞群。(iii) 在LSlowKlow細(xì)胞群中分析CLP細(xì)胞群。
高維分析
在排除粘連細(xì)胞后圈出每群細(xì)胞,在FlowJo軟件中分別進(jìn)一步分析LK和LSK細(xì)胞群,以進(jìn)行可視化分析,如圖3所示。將除去Lineage、live/dead、CD45.1和CD45.2以外的所有細(xì)胞表面標(biāo)記物進(jìn)行t-SNE分析,之后將t-SNE圖譜分為CD45.1和CD45.2兩類。隨后,將手動(dòng)圈門的細(xì)胞群應(yīng)用于t-SNE圖上,不同細(xì)胞群顯示不同顏色,并分布在t-SNE圖中不同位置。
圖 2. 高維分析。在去除碎片,粘連體,死亡和成熟造血細(xì)胞后,分別在LK和LSK群上進(jìn)行t-SNE分析(基于除了Lineage,live/dead,CD45.1和CD45.2之外的所有參數(shù)),以深入了解該14色方案的高維數(shù)據(jù)的復(fù)雜性。(A)t-SNE分析在LK細(xì)胞群中區(qū)分出了不同的髓系定向祖細(xì)胞群體將如圖2所示的各種髓系定向祖細(xì)胞類群疊加到 t-SNE 圖上(i-vi),t-SNE圖顯示了各種髓系定向祖細(xì)胞在總LK(i,iv),CD45.1+ LK(ii,v)和CD45.2+ LK(iii,vi)中的分布。(B)t-SNE分析將LSK細(xì)胞群中不同的MPPs以及HSCs細(xì)胞群區(qū)分開。將如圖2所示的不同MPPs和HSCs細(xì)胞群疊加到t-SNE圖上,t-SNE 圖顯示了他們在總LSK (vii)、CD45.1+ LSK (viii) 和 CD45.2+ LSK (ix) 的分布情況。
FMO對照
熒光減一對照(FMO)用于評估所有細(xì)胞表面標(biāo)記物的區(qū)分。結(jié)果如圖3所示,確認(rèn)了真正的陰性界限并進(jìn)一步驗(yàn)證了熒光的擴(kuò)散不影響門控,并且所有細(xì)胞表面標(biāo)記物沒有發(fā)生分辨率損失。
圖 3. 利用FMO對照來驗(yàn)證門控。通過FMO對照來確定除live/dead和Lineage之外的所有表面標(biāo)記物的背景染色來驗(yàn)證門控,其中FMO對照是除待分析的抗體外染色其他所有抗體。顯示的是完全染色的樣品和相應(yīng)的FMO的圖。FMO 對照的圈門與圖 1 一致。
結(jié)論
多色流式細(xì)胞術(shù)已成為免疫學(xué)研究的重要工具。該14色方案可用于小鼠造血干細(xì)胞和祖細(xì)胞的更深層次的表型表征,并大大提高我們對HSCs、MPPs和成熟血細(xì)胞之間關(guān)系的理解。我們的結(jié)果表明,使用安捷倫 NovoCyte Quanteon 流式細(xì)胞儀可以更好地檢測低表達(dá)的抗原,為我們了解小鼠造血系統(tǒng)提供了更深度的分析方案。
?參考文獻(xiàn)
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