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干貨—以qPCR方法為例談?wù)劶?xì)胞治療數(shù)據(jù)分析方法驗(yàn)證 (上篇)

德國耶拿生命科學(xué)部
2021.11.05

? ? ? ?細(xì)胞治療與基因治療行業(yè)目前正在蓬勃發(fā)展,每個新藥走上臨床都需要經(jīng)過IND申報(bào),在進(jìn)行IND申報(bào)則必須要對產(chǎn)品質(zhì)量控制的檢測方法進(jìn)行開發(fā)和驗(yàn)證,不論是委托第三方檢測,還是獨(dú)立完成,都需要根據(jù)2020藥典標(biāo)準(zhǔn)完成以下幾個項(xiàng)目的驗(yàn)證:專屬性、準(zhǔn)確度、精密度(包括重復(fù)性、中間精密度和重現(xiàn)性)、檢測限、定量限、線性、范圍和耐用性。由于分析方法具有各自的特點(diǎn),并隨分析對象而變化,因此需要視具體情況擬訂驗(yàn)證的指標(biāo)。

? ? ? ?我們以qPCR方法為例,來聊一聊如何設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)獲得數(shù)據(jù)完成這些驗(yàn)證項(xiàng)目。

? ? ? ?1、專屬性Specificity

? ? ? ?專屬性是指在其他成分(如雜質(zhì)、降解產(chǎn)物、輔料等)可能存在下,采用的分析方法能正確測定出被測物的能力。如方法專屬性不強(qiáng),應(yīng)采用多種不同原理的方法予以補(bǔ)充。

? ? ? ?鑒別反應(yīng)、雜質(zhì)檢査和含量測定方法,均應(yīng)考察其專屬性。

? ? ?? 對于qPCR方法來說,需要設(shè)置陰性對照,陽性對照,空白對照,在陰性對照和空白對照無Ct值,陽性對照有效擴(kuò)增的情況下,方才認(rèn)定專屬性成立;

? ? ? ??2、準(zhǔn)確度Accuracy

? ? ? ?準(zhǔn)確度是指用該方法測定的結(jié)果與真實(shí)值或參考值接近的程度,一般用回收率(%)表示。測定回收率R(recovery)的具體方法可采用“回收試驗(yàn)法”和“加樣回收試驗(yàn)法”。

? ? ? 根據(jù)準(zhǔn)確度數(shù)據(jù)要求,有兩種方案。

? ? ? 第一種在線性范圍內(nèi),取同一濃度(相當(dāng)于100%濃度水平)的供試品,用至少6份樣品的測定結(jié)果計(jì)算回收率進(jìn)行評價。

? ? ? 第二種方案在線性范圍內(nèi),設(shè)計(jì)高中低3種不同濃度,每種濃度分別制備3份供試品進(jìn)行測定,用至少9份樣品的測定結(jié)果進(jìn)行評價。

? ? ? 兩種方法的選定應(yīng)考慮分析的目的和樣品的濃度范圍。對于有關(guān)物質(zhì)檢查的準(zhǔn)確度,還需對定量限水平的準(zhǔn)確度進(jìn)行評價。

? ? ? 對于qPCR方法來說,準(zhǔn)確度的要求一般為回收率50~150%;這一驗(yàn)證項(xiàng)目里,可能出現(xiàn)挑戰(zhàn)的在于低濃度樣本,因此需要一個靈敏度高,數(shù)據(jù)重復(fù)性好的儀器來進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。

??? ? ?3、精密度Precision(包括重復(fù)性Repeatability、中間精密度Intermediateprecision和重現(xiàn)性Reproducibility)

? ? ? ?重復(fù)性是指在相同條件下,由同一個分析人員測定所得結(jié)果的精密度。

(如上圖所示,左邊的圖精密度良好,但是準(zhǔn)確度不符合要求;右邊的圖平均值的準(zhǔn)確度符合要求,但是精密度較差)?

? ? ? 重復(fù)性數(shù)據(jù)要求:在規(guī)定范圍內(nèi),取至少6份同一濃度(分析方法擬定的樣品測定濃度,相當(dāng)于100%濃度水平)的供試品,即實(shí)測樣品,進(jìn)行評價;或根據(jù)線性范圍,設(shè)計(jì)3種不同濃度,每種濃度分別制備3份供試品進(jìn)行測定,用至少9份樣品的測定結(jié)果進(jìn)行評價。

? ? ? 注意,對于qPCR方法來說,這6份樣品或9份樣品需要在同一次實(shí)驗(yàn)進(jìn)行。

? ? ? 中間精密度是指在同一個實(shí)驗(yàn)室,不同時間由不同分析人員用不同設(shè)備測定結(jié)果之間的精密度。中間精密度是考察隨機(jī)變動因素對精密度的影響,注意控制變量,每次只能驗(yàn)證一個項(xiàng)目。

? ? ? 重現(xiàn)性是指在不同實(shí)驗(yàn)室由不同分析人員測定結(jié)果之間的精密度。在分析方法從研發(fā)實(shí)驗(yàn)室轉(zhuǎn)到QC實(shí)驗(yàn)室的過程中,通常會進(jìn)行重現(xiàn)性的考察。

? ? ??含量測定和雜質(zhì)的定量測定都需要考察方法的精密度。

? ? ?精密度數(shù)據(jù)要求:對于qPCR方法,需要提供相對標(biāo)準(zhǔn)偏差RSD,計(jì)算公式如下,樣品中待測定成分含量和精密度RSD可接受范圍請參考ChP2021版中9101中可接受范圍表。

? ? ? 使用qPCR方法進(jìn)行絕對定量時,要求RSD≤30%,這一要求不僅針對最終定量數(shù)據(jù),對于儀器本身提供的Ct值的RSD也需要控制,儀器會提供一個SD值作為Ct值的精密度參考,一般以0.25為限。

? ? ???德國耶拿定量 PCR 儀在外源性宿主 DNA 殘留檢測方面有很多的實(shí)際應(yīng)用案例,客戶的使用體驗(yàn)反饋有:

l??儀器檢測靈敏度高

l??實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的重復(fù)性好

l??運(yùn)行速度快

l??中文軟件很好用

l??儀器運(yùn)行很安靜

? ? ? 分析方法驗(yàn)證介紹未完待續(xù)……

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