科研快訊 | 基于MGISEQ-2000的新型冠狀病毒基因組測(cè)序與新冠病毒變異研究
日前,山東省衛(wèi)生健康委和省科技廳共同實(shí)施“新冠肺炎疫情應(yīng)急技術(shù)攻關(guān)及集成應(yīng)用”重大科技創(chuàng)新工程獲階段性成果。山東第一醫(yī)科大學(xué)/山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院史衛(wèi)峰教授團(tuán)隊(duì)與山東省疾病預(yù)防控制中心等單位合作,完成了104個(gè)新冠病毒核酸樣本基因組測(cè)序。
研究團(tuán)隊(duì)經(jīng)過(guò)對(duì)山東省216份新型冠狀病毒確診病例的核酸樣本(提取自臨床樣本或細(xì)胞培養(yǎng)物),使用華大智造MGISEQ-2000進(jìn)行高通量測(cè)序,共獲得104個(gè)全長(zhǎng)或接近全長(zhǎng)(>99%)病毒基因組序列。通過(guò)對(duì)新冠病毒基因組序列進(jìn)行測(cè)序、相似性比較和變異位點(diǎn)研究,可以為構(gòu)建進(jìn)化圖譜、追溯病毒來(lái)源、追蹤變異路徑、了解病毒生物學(xué)特性及致病機(jī)理等提供重要參考信息,助力疫情防控。
據(jù)悉,隨著研究不斷深入,課題組將進(jìn)一步擴(kuò)大檢測(cè)樣本量,同時(shí)對(duì)已獲得的新冠病毒基因組信息進(jìn)行研究,及時(shí)反饋?zhàn)钚卵芯拷Y(jié)果,為打贏疫情防控阻擊戰(zhàn)提供科技支撐。
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