影響雜交的因素有哪些
1、核酸分子的濃度和場地:核酸分子濃度越高,復(fù)性速度就越快,探針長度最好選在50-300個堿基;
2、溫度:溫度偏高不利于復(fù)性,溫度偏低則不利于少數(shù)堿基配對形成的局部雙鏈的解離,適合的溫度是較Tm值低25度;
3、離子強度:離子強度越高,雜交反應(yīng)越快,而且高濃度的鹽有利于穩(wěn)定錯配堿基雜交體的穩(wěn)定性增加,所以在進行序列不完全同源的核酸分子雜交時,必須維持雜交液和洗膜液中鹽濃度;
4、雜交液中的甲酰胺:甲酰胺能降低核酸雜交反應(yīng)的Tm值,其優(yōu)點在于:在低溫下探針的穩(wěn)定性增加,且更好地保留非共價結(jié)合的核酸;
5、核酸分子的復(fù)雜性:是指存在于反應(yīng)體系中不同順序的總長度;
6、非特異性雜交反應(yīng):在開始核酸分子雜交之前須對非特異性雜交位點進行封閉,以減少其對探針的非特異性吸附作用。
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