基因測序結(jié)果怎么看
問題一：測序結(jié)果怎么分析 測序結(jié)果的分析
測序都是從5端進(jìn)行的，正向和反向測序是指對DNA的兩條互補鏈分別測序，通常兩個方向測序結(jié)果經(jīng)校讀后完全一致才能認(rèn)為得到可靠結(jié)果。生工測序結(jié)果一般都提供兩個文檔，一個是TEXT的序列文檔，一個是用Chromas軟件打開的ABI文檔。
1.尋找引物
blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 比對，去除引物序列，找到目的片段。
在DNAMan上進(jìn)行比對，看引物能不能比對上（一個不變，一個反向互補），如果比不上，那可能就不是你要的序列，如果能比上，上游以引物第一個為分界線，去除前面的；下有一最后一個為分界線，去除后面的，剩下的就是目的序列。然后在NCBI上Blast.就OK了。
批注：PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序的結(jié)果可能不包含引物序列
2.將找到的對應(yīng)目的片段轉(zhuǎn)成*.txt格式
3.下載BioEdit軟件
第一：打開Bioedit軟件，導(dǎo)入拼接好的樣品序列與標(biāo)準(zhǔn)亞型參考序列
File New Alignment Sequence New Sequence 導(dǎo)入拼接好的樣品序列和標(biāo)準(zhǔn)參考序列（從TEXT文檔利用復(fù)制粘貼工具） Apply and close 保存結(jié)果 關(guān)閉窗口
第二：點擊菜單欄上按鈕 Accessory Application ，選擇 Clustalw Multiple Alignment
File Open Accessory Application Clustalw Multiple Alignment
第三：比對結(jié)束后，刪除比對序列兩端的多余序列，使所有序列等長
選擇需要編輯的序列 Sequence Edit Sequence 進(jìn)行序列的編輯 保存修改后結(jié)果
第四：選擇 Sequence 菜單下的 Gaps ，點擊 Lock Gaps
第五：將比對后的序列保存為Fasta 格式文檔
4.下載MAGE4.0軟件
1) 打開MEGA軟件，選擇 File 菜單欄中的 Convert To MEGA Format ，把序列文件的格式轉(zhuǎn)換為meg文檔保存；
2) 雙擊序列的meg文檔，選擇 Nucleotide Sequences ，點擊 OK ；
3) 程序運行中詢問是否為蛋白編碼序列，選擇 NO ；
4) 在MEGA操作界面選擇 Phylogeny 菜單欄下 Bootstrap Test of Phylogeny 中的 Neibour-Joining ；
5) 選擇 Test of Phylogeny 欄中的 Bootsrap ， Replications 設(shè)定為1 000；在 Options Summary 欄中的 Model 項中，設(shè)定參數(shù)為 Kimura 2-Paramete r，最后選擇 pute ；
6) 將分析結(jié)果采用Los Alamos HIV序列庫提供的HIV-BLAST和Subtyping工具進(jìn)行驗證。...>>
問題二：dna測序結(jié)果分析怎么看進(jìn)化圖 如果是用Sanger測序的話，電泳得到的條帶是模板連的互補鏈，電泳的方向是有3‘段到5’段的，那么從下往上讀，就可以的出互補鏈，根據(jù)反向平行，就可以推倒出模板連的堿基序列。
問題三：怎樣分析基因測序結(jié)果 1.假設(shè)你測的是一個基因的序列,如果已知這個基因的序列,則將你測序得到的基因序列與已知的序列相比對,分析看兩者在哪個地方不對應(yīng),不對應(yīng)的地方即為突變的地方.比對的軟件有sequencher,或者去NCBI網(wǎng)站點擊BLAST進(jìn)行.
2.如果你測的是一個以前未知的序列,那么要測幾個不同的單克隆,將測得的結(jié)果進(jìn)行比對,分析一致的地方以及不一致的地方.
問題四：細(xì)菌基因組重測序結(jié)果分析報告怎么看 測序只是最基礎(chǔ)的，接下來你要做功能基因分析，查找確定哪一些是編碼基因的序列，然后做表達(dá)檢測。。 如果你事先知道自己的目的基因序列，測序結(jié)束后，應(yīng)該可以直接找到。
問題五：高通量基因測序檢驗報告單怎么看 哪個公司出的，可撥打他們的客服電話。從業(yè)人員素質(zhì)普遍較高，可以很詳細(xì)解答您的疑問。
問題六：如何看測序的結(jié)果與預(yù)期相差很大 先注意染色體與基因的關(guān)系，一條染色體有多個基因。
所以基因結(jié)構(gòu)變異（堿基對增、減、變）導(dǎo)致一個基因變。染色體結(jié)構(gòu)變異，導(dǎo)致多個基因的重復(fù)，缺失，排列順序的改變等。所以基因突變是某一性狀改變，而染色體變異是某一系列性狀的改變。
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