二代測序及其應(yīng)用
二代測序?yàn)楦咄繙y序,采用微珠或高密度芯片邊合成邊測序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次獲得數(shù)G數(shù)據(jù),相對與第三代,都仍然需要擴(kuò)增的方法放大信號,擴(kuò)增后再檢測。
二代測序應(yīng)用如下:
1、Illumina 原理:橋式PCR+4色熒光可逆終止+激光掃描成像。
2、Roche 454:油包水PCR + 4種dNTP車輪大戰(zhàn) + 檢測焦磷酸水解發(fā)光。
3、Ion Torrent 原理:油包水PCR + 4種dNTP車輪大戰(zhàn) + 微電極PH檢測。
二代測序相比一代測序大幅降低了成本,保持了較高準(zhǔn)確性,并且大幅降低了測序時(shí)間,將一個(gè)人類基因組從3年降為1周以內(nèi),但在序列讀長方面比起第一代測序技術(shù)則要短很多,這也給三代測序提供了發(fā)展空間。
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