Pacific Biosciences推出新的Sequel II測序系統(tǒng)
Pacific Biosciences of California Inc.(納斯達(dá)克股票代碼:PACB)是基因組,轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組的高質(zhì)量測序的領(lǐng)先供應(yīng)商,于4月24號(hào)宣布Sequel?II系統(tǒng)的商業(yè)發(fā)布。該系統(tǒng)包括新的8M SMRT?Cell,以及配套試劑,儀器控制軟件和SMRT Link軟件包。與之前的Sequel系統(tǒng)相比,新的系統(tǒng)進(jìn)一步降低了測序項(xiàng)目的成本和時(shí)間,其通量大約是之前的8倍。
PacBio已經(jīng)開始向客戶交付新的儀器,首批客戶是參加Sequel II測序儀早期測試的5個(gè)客戶,包括:Broad Institute, Wellcome Sanger Institute,HudsonAlpha Genome Sequencing Center,University of Maryland Institute for Genome Sciences和Icahn Institute for Data Science and Genomic Technology at Mount Sinai。所有5家早期試用客戶在測試結(jié)束后都購買了Sequel II系統(tǒng)。
Sequel II系統(tǒng)基于先前Sequel系統(tǒng)的成熟技術(shù)和工作流程,但同時(shí)也升級(jí)了硬件以支持新的8M SMRT Cell。Sequel II系統(tǒng)可以提供高準(zhǔn)確度的長讀長Reads(HiFi Reads),同時(shí)還可以產(chǎn)出達(dá)到Sanger測序質(zhì)量的Reads (精度>99.9% ), 通量大約是之前的8倍。
通過Sequel II系統(tǒng),客戶可以全面檢測各種類型的人類基因組變異,從單核堿基突變到長片段復(fù)雜結(jié)構(gòu)變異。同時(shí)Sequel II系統(tǒng)也是標(biāo)準(zhǔn)SMRT測序應(yīng)用的理想選擇,例如大型基因組的從頭組裝和使用Iso-Seq?方法的全長轉(zhuǎn)錄組分析。對(duì)Sequel II測序數(shù)據(jù)的分析表明,與Sequel系統(tǒng)相比,該系統(tǒng)可以提供相同或更高的測序精度。在僅有15倍人類基因組覆蓋度的情況下,HiFi reads就可以實(shí)現(xiàn)全面的人類基因組變異檢測。對(duì)于檢測結(jié)構(gòu)變異的精確度和敏感性能夠達(dá)到≥95%,對(duì)于檢測單堿基突變的精確度和敏感性可以達(dá)到≥99%,對(duì)于檢測短的插入和缺失的精確度和敏感性可以達(dá)到≥96%。
早期試用客戶還通過不同的測序應(yīng)用對(duì)Sequel II系統(tǒng)進(jìn)行了評(píng)估。來自HudsonAlpha Genome Sequencing Center的Jeremy Schmutz研究員評(píng)論說:“看到來自Sequel II系統(tǒng)的低成本人類基因組組裝序列接近人類參考基因組的質(zhì)量和完整性,這真是太神奇了,要知道人類參考基因組花費(fèi)了數(shù)十億美金和多年時(shí)間才達(dá)到現(xiàn)在的質(zhì)量。我們已經(jīng)將Sequel II系統(tǒng)用于人類基因組和復(fù)雜植物基因組的測序,結(jié)果與我們使用的Sequel系統(tǒng)一樣好,但是Sequel II擁有更高的通量。
來自University of Maryland Institute for Genome Sciences的科學(xué)主任Luke Tallon說 “根據(jù)我們的經(jīng)驗(yàn),Sequel II系統(tǒng)基本上可以立即投入生產(chǎn),我們已經(jīng)將它用于一系列應(yīng)用和樣品類型的測序 ?-從人類基因組到宏基因組和微生物組分析到非模型植物和動(dòng)物基因組,結(jié)果都非常好。對(duì)于我們這種每年處理數(shù)萬個(gè)微生物樣本的實(shí)驗(yàn)室而言,Sequel II系統(tǒng)有可能實(shí)現(xiàn)真正深入且經(jīng)濟(jì)高效的微生物組和宏基因組測序。
Pacific Biosciences首席執(zhí)行官M(fèi)ichael Hunkapiller博士說:“我們對(duì)早期試用測試的結(jié)果很滿意,這證實(shí)了我們對(duì)Sequel II系統(tǒng)的內(nèi)部評(píng)估是正確的。通過大幅提高產(chǎn)量,同時(shí)繼續(xù)提供具有行業(yè)領(lǐng)先精度的長讀長測序結(jié)果,Sequel II系統(tǒng)已經(jīng)在推動(dòng)科學(xué)向前發(fā)展,讓科學(xué)家有機(jī)會(huì)解決長期以來難以解決的問題。在早期試用期間運(yùn)行的第一個(gè)8M SMRT Cell是對(duì)一種植物基因組進(jìn)行測序,其基因組組裝連續(xù)性比目前公布的參考基因組高10倍。隨著越來越多的科學(xué)家使用這一卓越的測序系統(tǒng),我們期待看到更多有開創(chuàng)意義的測序結(jié)果?!?/p>
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