PCR擴(kuò)出來的條帶亮度很弱是什么原因
1. 模板的用量在你這種情況下應(yīng)該和目的條帶濃度關(guān)系不大——記得realtimePCR的原理圖么,循環(huán)數(shù)夠多時(shí),目的片段的終濃度在不同模板量條件下相差不大;
2.首先考慮擴(kuò)增效率問題,可用touch down PCR,除開頭幾個(gè)循環(huán)外,后面的退火溫度降低一些,可提高擴(kuò)增效率;
3.如果無效,建議使用兩步法,95度 1min,(60-65)度 3min,可加入touch down 步驟;
4.不知道反應(yīng)體系如何配置,應(yīng)該是使用了GCbuffer吧?TaKaRa的GCbuffer(尤其是II)的確會(huì)降低一些擴(kuò)增效率;
5.視你最終需要,如果是診斷目的,可多加一些Taq酶,也能增加擴(kuò)增效率,但錯(cuò)配率和非特異擴(kuò)增可能會(huì)增加。如果是克隆目的,其實(shí)目的條帶暗一些很多時(shí)候并不影響最終實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
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