RNA酶保護(hù)試驗(yàn)((RNase Protection Assay,RPA)簡(jiǎn)介
RNA酶保護(hù)試驗(yàn)((RNase Protection Assay,RPA)是通過(guò)液相雜交的方式,用反義RNA探針與樣品雜交,以檢測(cè)RNA表達(dá)的技術(shù)。
1。原理:雙鏈RNA(雜交的)能夠抵抗RNA酶的降解。
2。應(yīng)用:檢測(cè)RNA表達(dá)
3。與Northern雜交和RT-PCR比較,RPA有以下幾個(gè)優(yōu)點(diǎn):
1. 檢測(cè)靈敏度比Northern雜交高。由于Northern雜交步驟中轉(zhuǎn)膜和洗膜都將造成樣品和探針的損失,使靈敏度下降,而RPA將所有雜交體系進(jìn)行電泳,故損失小,提高了靈敏度。
2. 由于PCR擴(kuò)增過(guò)程中效率不均一和反應(yīng)“平臺(tái)”問(wèn)題,基于PCR產(chǎn)物量進(jìn)行分析所得數(shù)據(jù)的可靠性將下降,而RPA沒(méi)有擴(kuò)增過(guò)程,因此,分析的數(shù)據(jù)真實(shí)性較高。
3. 由于與反義RNA探針雜交的樣品RNA僅為該RNA分子的部分片段,因此,部分降解的RNA樣品仍可進(jìn)行分析。
4. 步驟較少,耗時(shí)短。與Northern雜交相比,省去了轉(zhuǎn)膜和洗膜的過(guò)程。
5. RNA-RNA雜交體穩(wěn)定性高,無(wú)探針自身復(fù)性問(wèn)題,無(wú)須封閉。
6. 一個(gè)雜交體系中可同時(shí)進(jìn)行多個(gè)探針雜交,無(wú)競(jìng)爭(zhēng)性問(wèn)題。
7. 檢測(cè)分子長(zhǎng)度可以任意設(shè)置,靈活性大。
RPA的缺點(diǎn)是需要同位素標(biāo)記探針。