《自然》:來(lái)自石正麗研究團(tuán)隊(duì)和張永振研究團(tuán)隊(duì)
昨日,頂尖學(xué)術(shù)期刊《自然》以“加快評(píng)審文章”(Accelerated Article Preview)形式上線(xiàn)兩篇有關(guān)新型冠狀病毒的論文。這兩篇備受關(guān)注的同行評(píng)議論文分別由中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所石正麗研究員領(lǐng)銜和復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院張永振教授領(lǐng)銜。
對(duì)于自2019年12月開(kāi)始從中國(guó)武漢流行的新型病毒性肺炎,石正麗研究團(tuán)隊(duì)鑒定病原體為新型冠狀病毒2019-nCoV,揭示了其與嚴(yán)重急性呼吸綜合征(SARS)冠狀病毒的相似性。這篇分析文章發(fā)現(xiàn)了新型冠狀病毒最初來(lái)源于蝙蝠的證據(jù),但研究者指出,此次爆發(fā)的動(dòng)物來(lái)源尚待確認(rèn)。
在疫情爆發(fā)初期,石正麗研究員與同事們分析了7例重癥肺炎患者的樣本,其中6人為武漢華南海鮮市場(chǎng)內(nèi)的工人。研究者從其中5名患者的樣本中獲取了病毒的全長(zhǎng)度基因組序列,發(fā)現(xiàn)彼此之間幾乎完全一致,相似度超過(guò)99.9%,并且與2003年引起SARS的冠狀病毒有79.5%的序列一致。
此外,研究人員發(fā)現(xiàn)2019-nCoV在全基因組水平上與一種蝙蝠冠狀病毒有高達(dá)96%的相似度,表明蝙蝠可能是該冠狀病毒的來(lái)源。
研究者根據(jù)冠狀病毒基因組中變異性最高的片段開(kāi)發(fā)了檢測(cè)用的引物序列,可以快速將2019-nCoV與其他所有人類(lèi)冠狀病毒區(qū)分開(kāi)。他們發(fā)現(xiàn),其中5名患者收治初期的口腔拭子樣本中即能檢測(cè)到2019-nCoV,而在大約十天后再次核酸檢測(cè)未有明顯陽(yáng)性結(jié)果。研究者推測(cè)最有可能的病毒傳播途徑是通過(guò)個(gè)體的呼吸道,但也表示,“并不能排除其他途徑,仍需更多患者數(shù)據(jù)來(lái)進(jìn)一步研究傳播途徑”。
而在這項(xiàng)研究中,“更重要的是,我們已經(jīng)確認(rèn),這種新型冠狀病毒與SARS冠狀病毒使用相同的細(xì)胞受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶(ACE2)進(jìn)入細(xì)胞。”研究作者下結(jié)論。
這篇論文在1月23日公布于預(yù)印網(wǎng)站,研究者第一時(shí)間公開(kāi)了他們的發(fā)現(xiàn),昨日《自然》經(jīng)過(guò)同行評(píng)議正式發(fā)表。
在背靠背發(fā)表的另一篇論文中,張永振教授的研究團(tuán)隊(duì)根據(jù)對(duì)2019-nCoV的基因組序列分析,表明該病毒與此前在一種中國(guó)蝙蝠體內(nèi)找到的一組SARS樣冠狀病毒密切相關(guān)。
張永振教授與同事們分析了一例41歲男性患者,為華南海鮮市場(chǎng)工人,其于2019年12月26日在武漢中心醫(yī)院住院,表現(xiàn)出呼吸系統(tǒng)疾病癥狀,包括發(fā)燒、胸悶和咳嗽。聯(lián)合使用抗生素、抗病毒藥和糖皮質(zhì)激素進(jìn)行治療,但患者表現(xiàn)出呼吸衰竭,治療三天后病情無(wú)改善。
研究者從患者支氣管肺泡灌洗液收集樣本,通過(guò)基因組RNA測(cè)序,鑒定出一種新型冠狀病毒。對(duì)29903個(gè)核苷酸的完整病毒基因組進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析后發(fā)現(xiàn),該病毒與蝙蝠體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的SARS樣冠狀病毒有89.1%的核苷酸相似性。從單個(gè)患者的分析中無(wú)法得出結(jié)論認(rèn)為該冠狀病毒是當(dāng)前疫情爆發(fā)的原因,不過(guò)針對(duì)其他患者的獨(dú)立調(diào)查研究證實(shí)了這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)。
兩項(xiàng)研究的測(cè)序序列分別可以在流感數(shù)據(jù)庫(kù)GISAID和NCBI的SRA數(shù)據(jù)庫(kù)中找到,病毒完整基因組已存入GenBank。這些共享的研究數(shù)據(jù)可以供全世界科研人員繼續(xù)深入研究新型冠狀病毒的源頭。
截至2020年2月3日,全球感染2019-nCoV的人數(shù)已超過(guò)1.7萬(wàn)人。我們期待更多研究數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)可以得到公布,追溯疫情爆發(fā)的來(lái)源,了解這種病毒的傳播方式,以更好地指導(dǎo)疾病的預(yù)防、控制和治療。
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