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蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析

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AI問答
可以做哪些實驗,檢測什么? 可以用哪些耗材和試劑?

多層組學(xué)整合分析是指對來自基因組、轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、代謝組和脂質(zhì)組等不同生物分子層次的批量數(shù)據(jù)進行歸一化處理、比較分析和相關(guān)性分析等統(tǒng)計學(xué)分析,建立不同層次分子間數(shù)據(jù)關(guān)系。同時結(jié)合GO功能分析、代謝通路富集、分子互作等生物功能分析,系統(tǒng)全面地解析生物分子功能和調(diào)控機制。不同分子層次的組學(xué)數(shù)據(jù)進行整合分析一方面可以相互驗證,另一方面也有助于相互補充,最終實現(xiàn)對生物變化大趨勢與方向的綜合了解,提出分子生物學(xué)變化機制模型,并篩選出重點代謝通路或者蛋白、基因、代謝、脂質(zhì)產(chǎn)物進行后續(xù)深入實驗分析與應(yīng)用。

應(yīng)用方向

生物領(lǐng)域各個研究方面,如:

? 農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機制,生長發(fā)育機制,育種保護研究等;

? 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機理研究等;

? 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標(biāo)志物,疾病機理機制,疾病分型,個性化治療等;

? 生物醫(yī)藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發(fā)等;

? 微生物領(lǐng)域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;

? 海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;

? 生物能源、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危定風(fēng)險評估研究等;

? 食品營養(yǎng):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測等。

數(shù)據(jù)分析

數(shù)據(jù)分析

? 蛋白質(zhì)組與代謝組多變量統(tǒng)計學(xué)整合分析:

O2PLS關(guān)聯(lián)分析、OPLS相關(guān)變量的篩選

? 蛋白質(zhì)組與代謝組KEGG代謝通路整合分析:

O2PLS關(guān)聯(lián)分析、OPLS相關(guān)變量的篩選

? 蛋白質(zhì)組與代謝組相關(guān)性分析:

相關(guān)系數(shù)矩陣熱圖、相關(guān)性分析層次聚類熱圖、相關(guān)系數(shù)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析
? 蛋白質(zhì)組與代謝組PCA比較分析(限≥3組)

技術(shù)優(yōu)勢

? 通過對不同層面的表達(dá)水平分析,實現(xiàn)對蛋白質(zhì)及代謝物的全譜分析。

? 同時實現(xiàn)從“因”和“果”兩個方向探究生物學(xué)問題,相互間的驗證作用更明顯。

? 闡述分子調(diào)控-表型間的關(guān)聯(lián)機制,系統(tǒng)全面地解析生物分子功能和調(diào)控機制。

? 從海量的數(shù)據(jù)中去偽存真,篩選出重點代謝通路或者基因、代謝產(chǎn)物進行后續(xù)深入實驗分析與應(yīng)用。

參考文獻

1. Proteomics integrated with metabolomics: analysis of the internal causes of nutrient changes in alfalfa at different growth stages. BMC Plant Biol. 2018.

前期研究報道“牧草之王-苜?!痹谶M入開花期后,總蛋白含量下降,纖維素含量增加,導(dǎo)致營養(yǎng)價值下降。本文對不同生長階段的苜蓿進行蛋白質(zhì)組和代謝組分析,通過KEGG代謝通路整合,發(fā)現(xiàn)跟氨基酸及苯丙素類合成、淀粉和蔗糖代謝等相關(guān)通路發(fā)生明顯富集,揭示引起營養(yǎng)成分變化的分子生物學(xué)機制,為改良獲得高品質(zhì)的苜蓿提供理論基礎(chǔ)。


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