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布魯克 timsTOF HT捕集離子淌度質(zhì)譜 4D-蛋白質(zhì)組學的功能

參考報價: 面議 型號: timsTOF HT
品牌: 布魯克 產(chǎn)地: 德國
關(guān)注度: 855 信息完整度:
樣本: 典型用戶: 暫無
功能串聯(lián)類型離子淌度譜
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AI問答
可以做哪些實驗,檢測什么? 可以用哪些耗材和試劑?

經(jīng)過30多年的發(fā)展,離子淌度質(zhì)譜已配有多種最新的離子源及質(zhì)量分析器,理論研究也日漸成熟,并在蛋白質(zhì)、多肽及復(fù)雜化合物異構(gòu)體分析方面越發(fā)顯示出獨特的優(yōu)勢,正在發(fā)展成為一種新型的重要分析工具。

擴展高通量 4D-蛋白質(zhì)組學的功能

速度: timsTOF HT 使用的 PASEF? 技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)在不影響分辨率和靈敏度的情況下達到超過 150 Hz 的掃描速度。

耐用性: 獨特的儀器設(shè)計使得其可以連續(xù)分析數(shù)千個樣品,儀器保持穩(wěn)定的性能而無需清潔。

靈敏度: 第四代 TIMS-XR 的超大離子容量極大提升了分析深度。

選擇性: 在四極桿和飛行管之前提供額外一維淌度分離,大大提升了峰容量。



捕集型離子淌度分離,支持 CCS 值分析

全新的 timsTOF HT 質(zhì)譜儀整合了第四代超高離子容量的 TIMS-XR 分析器和更先進的數(shù)字轉(zhuǎn)換技術(shù)。新的設(shè)計為無與倫比的蛋白質(zhì)組學分析深度和高通量定量分析提供了更寬的動態(tài)范圍。timsTOF HT 提供全面的 CCS 值輔助分析,并支持所有基于平行累積連續(xù)碎裂技術(shù)( PASEF? )的數(shù)據(jù)采集模式,PASEF?、dia-PASEF? 和 prm-PASEF? 使得 4D-蛋白質(zhì)組學分析擁有更高的靈活性,輕松實現(xiàn)蛋白質(zhì)組的全覆蓋。

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PaSER

PaSER 是一款 “ 運行即完成 ”( run and done )的實時數(shù)據(jù)庫搜索平臺,能夠最大限度的提升鑒定深度和分析通量。內(nèi)嵌 TIMScore? 和 TIMS DIA-NN 模塊使得其能充分利用 CCS 值輔助分析,使得蛋白質(zhì)鑒定更可靠。

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dia-PASEF? 實現(xiàn)更快速的組織樣本蛋白質(zhì)組學分析

針對心臟組織樣本的快速蛋白質(zhì)組學分析示例。通過 dia-PASEF? 和 30 分鐘短梯度色譜分離,對不同樣本量的小鼠心臟組織蛋白酶解液進行三次重復(fù)分析。在進樣量為 800ng 時,能鑒定到 4700 個蛋白,蛋白相對豐度跨越 5 個數(shù)量級。原始數(shù)據(jù)使用 DIA-NN 的非建庫模式進行數(shù)據(jù)檢索,蛋白拷貝數(shù)通過 ‘proteomics ruler’ 方法進行估算。

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dia-PASEF? 和 TIMS DIA-NN、PaSER 的強大組合使細胞系蛋白質(zhì)組獲得前所未有的深度覆蓋

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加大蛋白酶解液的進樣量能夠提高鑒定量,獲得更高的蛋白覆蓋深度。如圖為使用 Aurora-25 cm 色譜柱,在 250nL/min 的流速下,通過 60 分鐘色譜梯度洗脫,結(jié)合 timsTOF HT 質(zhì)譜儀的 dia-PASEF?( 100 毫秒淌度分離 )數(shù)據(jù)采集模式對人類細胞系 K562 的胰酶消化液進行質(zhì)譜分析結(jié)果。采集后的數(shù)據(jù)通過 TIMS DIA-NN 搜庫分析,數(shù)據(jù)庫為 uniprot 人源已注釋蛋白。

靶向血漿蛋白質(zhì)組學:30 分鐘梯度定量超過 550個蛋白

timsTOF HT 的 dia-PASEF? 采集方式與 Biognosys 公司的 PQ500 穩(wěn)定同位素標肽技術(shù)結(jié)合,對血漿蛋白質(zhì)組進行靶向分析。在 30 分鐘色譜梯度下,可以實現(xiàn)對 578 個蛋白( 對應(yīng) 804 條多肽 )的準確定量,數(shù)據(jù)完整性超過 99%。該方法通過一個簡單快捷的采集設(shè)置將傳統(tǒng) SMS/MRM 技術(shù)的選擇性和靈敏度結(jié)合起來,并能夠根據(jù)經(jīng)驗后續(xù)再進行新靶標的選擇。

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適用于更高進樣量的納升流速液相色譜柱


PepSep 25cm 系列色譜柱( 內(nèi)徑 150 um,粒徑 1.5 um ),對于上樣量達到 1600ng 的 K562 酶解肽段進行分析時,依然能夠保持平均峰寬小于 5 秒。41 分鐘的色譜梯度足夠支持有效的肽段分離,即便是更高的上樣量,也能夠獲得同源性多肽的分離。

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A)全新的 TIMS-XR 分析器擁有更高的離子容量可支持高于 200ng 的上樣量??煞€(wěn)定重現(xiàn)鑒定 ~ 6900 個蛋白質(zhì),超過 86000 條特異性肽段。

B)不同進樣量的 K562 酶解液采用 dda-PASEF 模式采集,使用 PaSER 實時搜索引擎和 TIMScore? 算法得到的鑒定結(jié)果。誤差值為五次重復(fù)的標準偏差。

PepSep 25cm 系列色譜柱( 內(nèi)徑 150 um,粒徑 1.5 um ),對于上樣量達到 1600ng 的 K562 酶解肽段進行分析時,依然能夠保持平均峰寬小于 5 秒。41 分鐘的色譜梯度足夠支持有效的肽段分離,即便是更高的上樣量,也能夠獲得同源性多肽的分離。


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注:該產(chǎn)品未在中華人民共和國食品藥品監(jiān)督管理部門申請醫(yī)療器械注冊和備案,不可用于臨床診斷或治療等相關(guān)用途

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